Lời Thì Thầm Từ Quá Khứ xoay quanh hành trình đầy day dứt của Lan (do Phan Minh Huyền thủ vai), một cô gái chìm đắm trong nỗi đau mất mát khi người chồng sắp cưới Tuấn (Tiến Lộc) ra đi đột ngột trong hoàn cảnh đầy bí ẩn. Cái chết ấy không chỉ cướp đi tình yêu mà còn để lại trong lòng Lan những cơn dằn vặt triền miên, những đêm dài trằn trọc với câu hỏi tại sao và những ký ức ùa về như dao cứa. Rồi một đêm, linh hồn Tuấn bất ngờ hiện về, giọng nói thì thầm đầy lưu luyến vang vọng bên tai Lan. Anh tiết lộ rằng mình đã chết nhưng linh hồn vẫn lạc lối, chưa thể siêu thoát vì còn bao điều dang dở, những giấc mơ chưa kịp chạm tới, những lời hứa chưa thực hiện. Lời van xin ấy đánh thức trong Lan sức mạnh lạ lùng. Cô quyết định sát cánh cùng Kiên (Thanh Sơn) và Đạt (Chí Nhân) – hai người bạn chí cốt của Tuấn, những gã trai từng gắn bó keo sơn từ thuở sinh viên – để hoàn thành nốt những hoài bão ấy. Họ lùng sục khắp nơi, từ những con phố cũ kỹ nơi Tuấn từng lang thang đến những góc khuất gia đình, thực hiện từng việc một cách tỉ mỉ, đầy cảm xúc. Chính trong những tháng ngày ấy, Lan dần hé mở những lớp vỏ bọc của quá khứ. Cô nhìn thấy những mảng tối u ám trong tính cách Tuấn – những bí mật anh giấu kín, những sai lầm từng mắc phải. Đồng thời, những người xung quanh cũng lộ ra chân dung thật: Kiên với nỗi lòng thầm kín dành cho Lan, Đạt với gánh nặng gia đình đè vai, và cả những mối quan hệ rối ren từ bạn bè đến người thân. Mỗi bước đi là một lời thì thầm từ quá khứ, dẫn dắt Lan đối mặt sự thật, chữa lành vết thương và tìm thấy ánh sáng mới giữa bóng tối.