Các động vật Madagascar bay trở lại thành phố New York, nhưng lại rơi xuống một khu bảo tồn thiên nhiên châu Phi, nơi chúng gặp gỡ những người khác cùng loại với mình, và Alex đặc biệt phát hiện ra di sản hoàng gia của mình với tư cách là hoàng tử sư tử kiêu hãnh.