Cự Xà Trường Nữ Sinh kể về một cơ sở nuôi rắn bí mật ở ngoại ô Hải Tây. Ông chủ cho nó ăn thức ăn có hàm lượng hormone cao một cách liều lĩnh, và đàn rắn dần dần đột biến. Một ngày nọ, một bầy rắn hung dữ thoát ra khỏi lồng và bắt đầu điên cuồng tấn công con người trong cơ sở nuôi rắn. Đồng thời, đàn rắn cũng bò về phía một trường hàng không cách cơ sở nuôi rắn không xa. Nhà trường đang chuẩn bị cho lễ tốt nghiệp, sinh viên không biết mình sắp gặp nguy hiểm vẫn tiến hành cuộc thi của trường. Đàn rắn bò vào nhiều nơi khác nhau của trường, một số nữ sinh bị rắn cắn, tiếng la hét khiến cả khu ký túc xá giật mình, các nữ sinh bỏ chạy tán loạn.