Lấy nhân vật trung tâm là Như Phi (Đặng Tụy Văn), cuộc chiến chốn thâm cung chỉ thực sự bắt đầu khi Như Phi bị đẩy vào lãnh cung. Lúc này, người tì nữ trung thành của cô (Thái Thiếu Phân) vẫn tình nguyện đi theo hầu hạ và giữa cặp chủ – tớ này đã nảy sinh một mối quan hệ "tình yêu đồng tính trong tâm tưởng". Trong thời gian nhàm chán ở lãnh cung, Như Phi đã làm quen với một kép hát (Trần Hào) và bắt đầu cảm thấy rung động trước người đàn ông này.Nhưng trớ trêu thay, chàng kép hát này đã có ý trung nhân – người bạn thanh mai trúc mã tâm đầu ý hợp tại đoàn kịch (Trần Vỹ). Đồng thời, "người tình đồng tính" của Như Phi cũng đã bắt đầu bất mãn và tổn thương trước sự lạnh nhạt của chủ nhân đối với mình. Cô tì nữ này quyết định phản lại, trở thành đối thủ đáng gờm nhất chốn hậu cung của Như Phi. Chưa kể, Uyển Tú (Ngũ Vịnh Vy) – em gái Như Phi – cũng luôn tìm cách hãm hại chính chị gái mình.Bên cạnh đó, với danh nghĩa tác phẩm "đinh" trong năm 2012 của TVB, nhà đài đã quyết định "chi mạnh" cho Cuộc chiến chốn thâm cung 2 để lấy lại vị thế sau một loạt vụ lùm xùm và "chảy máu" tài năng. Theo đó, ngay từ khi phác thảo kịch bản chính thức, Trần Hào và Trần Vỹ đã phải khăn gói tới đoàn kịch Giang Tô để "tầm sư học đạo", phục vụ cho vai diễn võ sinh – hoa đán của mình trong phim.Với tình hình cạnh tranh khốc liệt tại thị trường truyền hình Hồng Kông hiện nay, TVB phải tự bảo vệ mình để tránh việc bị các đối thủ qua mặt. Lần này sản xuất Cuộc chiến chốn thâm cung 2, TVB đã ra "trát" cấm toàn bộ nhân viên, diễn viên trong đài tiết lộ về nội dung phim. Có lẽ, vụ việc bị lộ kịch bản sơ lược trước ngày tổ chức họp báo đã khiến TVB "tỉnh" ra rằng: giờ đây việc giữ vị trí số 1 tại đất Cảng thơm đã không còn đơn giản nữa rồi.